梅尼埃病患者外周单核细胞的基因表达谱分析及药物发现
【作者】黄巧 翟思佳 廖行伟 刘宇超 尹时华
【关键词】
梅尼埃病 基因表达谱 药物发现
【摘要】目的应用公开数据库寻找可能与梅尼埃病(Meniere's disease,MD)发病机制相关的基因和分子途径,以及筛选MD潜在治疗药物。方法通过Gene Expression Omnibus(GEO)数据库获取GSE109558数据集,筛选MD与正常样本间外周单核细胞的差异表达基因,并进行功能注释、通路分析和蛋白质-蛋白质相互作用PPI(Proteinprotein interaction,PPI)网络构建。最后应用Connectivity map(cMAP)数据库筛选潜在治疗MD的小分子药物。结果差异表达基因显著富集在对病毒的反应、防御反应、趋化、MHC II类蛋白结合等生物过程,以及Influenza A和Herpes simplex infection信号通路。网络分析发现一些核心基因,如CXCL10、IFI44L。筛选出33个治疗MD的候选小分子药物,如赖诺普利、柚皮素等。结论MD可能具有自身炎症性内耳疾病,外周单核细胞中CXCL10、IFI44L、IFI44、XAF1、OAS2、HERC5、EIF2AK2表达水平的升高和POTEE表达水平的降低可能与MD发病机制有关。筛选出的小分子药物,如赖诺普利、柚皮素、伏立诺他等有可能成为MD的治疗或者辅助药物。
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